近年來致力于研究腫瘤組學大數(shù)據(jù)信息處理的理論與方法，在組學數(shù)據(jù)低維特征學習、腫瘤細胞狀態(tài)的精準識別與命運調(diào)控等方面取得了若干成果。成果發(fā)表于 Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、Gastroenterology 等國際尖端期刊，獲得國家自然科學基金優(yōu)秀青年科學基金資助。

報告摘要：

"腫瘤異質(zhì)性是腫瘤診療面臨的重大挑戰(zhàn)。近年來單細胞組學技術的發(fā)展使得從單細胞層面解讀腫瘤異質(zhì)性成為可能。結(jié)合國際新進展與課題組的研究成果，以肝癌、胰腺癌、白血病等為例，探討如何在單細胞水平研究腫瘤細胞以及腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性、如何整合單細胞組學與傳統(tǒng)組學信息。介紹課題組新開發(fā)的腫瘤單細胞轉(zhuǎn)錄組分析軟件 scCancer，助力腫瘤異質(zhì)性研究。

主要研究腫瘤領域單細胞測序數(shù)據(jù)分析。

報告摘要：

單細胞測序技術的發(fā)展極大地促進了腫瘤異質(zhì)性的研究。本次分享，將介紹古槿老師課題組新開發(fā)的腫瘤單細胞轉(zhuǎn)錄組分析軟件 scCancer。該軟件在整合了單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)常規(guī)分析（如聚類、差異表達分析等）的基礎上，還考慮了更多腫瘤樣本的特點，加入了以下腫瘤相關的分析：更全面的質(zhì)控、腫瘤微環(huán)境主要細胞類型辨識、細胞惡性估計、腫瘤內(nèi)部異質(zhì)性分析、細胞交互分析、多樣本整合分析等。所有分析均以用戶友好的方式進行執(zhí)行與展示。

遺傳學碩士，在校期間主要從事基因組學和分子遺傳學研究。參與多項國家“863”計劃項目和自然科學基金項目；擁有高通量行業(yè) 8 年生信分析實戰(zhàn)經(jīng)驗，累計協(xié)助完成 400 余例科研項目的設計、數(shù)據(jù)分析，培訓學員上百。目前在上海伯豪生物技術有限公司擔任單細胞項目負責人，對高通量基因組學技術的應用及數(shù)據(jù)分析，尤其是 lncRNA、circRNA 等非編碼 RNA 的研究，以及單細胞水平的測序技術有豐富的經(jīng)驗。

報告摘要：

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