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單細胞核 RNA 測序(snRNA-seq)優勢
1、冷凍組織可以用于直接抽提細胞核,為臨床回顧性研究中單細胞測序的開展提供了解決方案。
2、有些組織通過酶解消化很難拿到高質量的細胞懸液,通過抽提細胞核,避開酶解消化,是一個更好的選擇。
3、適用于對解離酶敏感(如神經元、肝實質細胞)、直徑較大、形狀不規則(如心肌細胞)等特殊細胞類型。
4、直接從組織抽提細胞核,不需要酶解消化及恒溫孵育,避免了組織解離過程中誘導應激基因的表達。
伯豪生物豐富的單細胞核抽提經驗
利用自主研發的“伯優 ? 細胞核分離試劑盒”已經完成大腦皮層、下丘腦、海馬、延髓、松果體、肝臟、心臟、膠質瘤、骨、乳腺和胰腺等 20 多種組織的抽核制備及上機測序。
送樣要求
1、組織用量:黃豆粒大小 1 塊;
2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;
3、質量要求:組織 RNA 無降解,RIN≥7;
4、運輸方式:干冰運輸。
結果展示
1、腦組織
腦組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:神經元(Neurons)73.0%;星形膠質細胞(Astrocytes)9.4%;少突膠質細胞(Oligodendrocytes)9.2%;內皮細胞(Endothelial cells)6.7%;小膠質細胞(Microglial cells)1.4% 及嗅鞘膠質細胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。
2、心臟組織
心臟組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:心肌細胞(Cardiomyocytes)38.8%;內皮細胞(Endothelial cells)30.3%;成纖維細胞(Fibroblasts)16.6;神經元細胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬細胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;間皮細胞(Mesothelial cells)0.6%;T 和 B 細胞分別占 0.4%;中性粒細胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪細胞(Adipocytes)0.2% 及髓細胞(Myeloid cells)0.1%。
3、肝臟組織
肝臟組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:肝細胞(Hepatocytes)56.0%;內皮細胞(Endothelial cells)10.9%;膽管細胞(Cholangiocytes)9.4%;成纖維細胞(Fibroblasts)9.2%;星狀細胞(Stellate cells)8.7%;T 細胞 4.7% 及 B 細胞 1.1%。
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